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2019-nCoV presque contenu dans certaines régions ?

2019-nCoV presque contenu dans certaines régions; un nouveau taux de mortalité de 6,5%; Le Hubei toujours en crise

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La tension sur l’évolution de la situation avec la nCoV 2019 s’est intensifiée sur la scène mondiale ces derniers jours, alors que les pays du monde entier ont mis en œuvre des mesures renforcées pour contenir l’épidémie, tandis que les experts ont commencé pour la première fois à sonner publiquement l’alarme que le nouveau coronavirus pourrait devenir pandémique .

Le monde est confronté à l’incertitude quant à savoir lequel des deux résultats émergera dans les semaines et les mois à venir: soit le contrôle et l’extermination éventuelle du nCoV 2019 chez l’homme, comme cela s’est produit avec le SRAS, soit le coronavirus devenant endémique et / ou pandémique et troublant l’humanité pendant beaucoup plus longtemps que certains l’avais supposé.

Nous rendons compte de cette situation en détail ci-dessous, mais brièvement:

  • Les dernières études suggèrent que la plupart des transmissions de 2019-nCoV sont symptomatiques, même si une transmission asymptomatique est possible
  • Il n’y a toujours pas de véritable clarté sur le taux de létalité, malgré le chiffre CFR de 2% largement cité. Une nouvelle étude en provenance de Chine place le CFR à 6,5%.
  • Le Hubei continue de fondre, avec une croissance de 56% des cas confirmés au cours des deux derniers jours, le nombre de cas submerge tous les établissements médicaux disponibles et les pénuries critiques de fournitures importantes
  • La situation au Hubei est encore pire que ne le suggèrent les statistiques officielles, avec une crémation généralisée des cas de pneumonie décédés qui ne sont pas comptés comme des cas confirmés, selon un rapport censuré d’un magazine chinois indépendant. Cependant, on ne sait pas encore si ces problèmes de notification sont marginaux ou très importants
  • En Chine, en dehors du Hubei, la quarantaine semble prendre effet et ralentit ou arrête la croissance du nombre de cas, ce qui augmente la possibilité que l’épidémie puisse être exterminée comme le SRAS
  • La situation politique chinoise semble volatile, mais avec peu d’indications sur ce que cela pourrait signifier
  • La croissance du nombre de cas en dehors de la Chine a été encore plus réduite, de sorte que l’extermination dans les premiers pays du monde semble tout à fait possible
  • D’éventuelles flambées épidémiques plus étendues dans les pays du tiers monde préoccupent davantage les autorités mondiales de santé publique, mais jusqu’à présent aucune n’a été confirmée
  • La situation évolue encore rapidement et de nombreuses questions importantes restent sans réponse

Les chercheurs commencent à se familiariser avec les propriétés de 2019-nCoV

Les chercheurs ont confirmé que le 2019-nCoV peut se propager asymptomatiquement , par contact avec la peau et, comme certains autres coronavirus, par les matières fécales.

Une étude de cohorte des 425 premiers cas de médecins chinois à Wuhan a récemment été publiée dans le New England Journal of Medicine, et comprenait des estimations de la taille de l’épidémie zoonotique initiale, et des périodes de latence et d’incubation du virus et du temps de doublement natif . Il s’agit de la première étude significative à suivre les cas depuis le début de la maladie, et la plus grande étude de cohorte à ce jour, ce qui en fait la meilleure lecture directe sur les propriétés de la maladie. Ils estiment que l’épidémie zoonotique initiale a été plus importante qu’on ne le pensait, avec près de 50 cas identifiés directement liés au marché des fruits de mer de Huanan.

L’étude de cohorte NEJM suggère que l’intervalle de série médian de la maladie est d’environ sept jours, comme on le croyait précédemment, et que la période allant de l’infection aux symptômes ne dure en moyenne que quatre à cinq jours, mais peut aller jusqu’à quelques semaines. Cela suggère que la plupart des infections ne sont pas asymptomatiques, même si cela est possible.

Il signale également que la chronologie de la maladie est longue, avec la plupart des patients qui sont hospitalisés et arrivant à l’hôpital après que plus d’une semaine se soit écoulée depuis le début des symptômes.

Le taux de létalité des cas de la nCoV en 2019, l’un des facteurs les plus importants pour déterminer le degré de dommages que l’humanité subira dans une épidémie généralisée ou une éventuelle pandémie, reste très incertain, les estimations variant toujours sur un ordre de grandeur d’environ 1% à aussi élevé que supérieur à 10%.

L’étude NEJM n’a pas abordé directement la CFR, tandis qu’une récente étude d’ajustement de modèle de l’Académie chinoise des sciences basée sur le nombre de cas, les décès et les nombres de récupération a estimé la CFR actuelle du virus à 6,5%.

Les travaux se poursuivent sur les vaccins et les thérapies

Des équipes du monde entier travaillent toujours à développer et tester des thérapies pour 2019-nCoV. La recherche de médicaments antiviraux existants qui pourraient être efficaces contre le nCoV 2019 a atterri sur les inhibiteurs de protéase comme candidats les plus probables, avec trois médicaments d’Abbvie (lopinavir et ritonavir) et Gilead (remdesivir) considérés comme les principaux candidats.

Abbvie a développé le lopinavir et le ritonavir comme thérapies contre le VIH, tandis que Gilead a initialement développé le remdesivir pour Ebola. Tous les trois sont expédiés à Wuhan pour des essais précoces, et une équipe en Thaïlande a déjà signalé un succès précoce avec le lopinavir et le ritonavir chez un petit nombre de patients.

De nombreux virus contiennent des protéases, qu’ils utilisent pour séparer des protéines virales fonctionnellement différentes qui sont transcrites et traduites ensemble, et sans lesquelles une cellule infectée ne peut pas assembler de nouveaux virions. Parce que toutes les protéases partagent des liaisons peptidiques comme substrat, leurs sites actifs ont certaines similitudes qui rendent les inhibiteurs de protéase parfois plus portables d’un virus à un autre que certaines autres classes de médicaments antiviraux. Si ces inhibiteurs du protéasome s’avèrent efficaces contre le 2019-nCoV, ils sont actuellement suffisamment disponibles et assez simples à administrer pour pouvoir être rapidement déployés pour la plupart des patients du 2019-nCoV.

Une société américaine, Moderna Therapeutics, basée à Cambridge, dans le Massachusetts, a annoncé qu’elle travaillait sur un vaccin à ARN pour 2019-nCoV, qui, selon elle, pourrait être prêt pour un essai humain de phase 1 avec des volontaires sains dans trois mois.

Les vaccins à ARN, une arrivée récente dans le monde des vaccins, sont beaucoup plus faciles à fabriquer que les vaccins traditionnels, car au lieu d’être fermentés dans une culture virale, ils peuvent être fabriqués dans la chaîne d’approvisionnement de fabrication établie pour les acides nucléiques, qui est en grande partie insensible à laquelle séquence est en cours de fabrication. En conséquence, l’intensification de la fabrication d’un acide nucléique thérapeutique peut être presque instantanée, tandis que l’extension des vaccins traditionnels peut prendre beaucoup de temps. Cependant, il est difficile de savoir si un tel vaccin sera réellement prêt dans les délais courts, et à quel point il serait efficace.

Toujours pas une arme biologique

Toutes les indications continuent de montrer que 2019-nCoV n’est pas une arme biologique.

Nous avons précédemment couvert les théories du complot à ce sujet sur la base de l’emplacement du premier institut de virologie de Chine , et un article de l’Inde qui a trouvé des chevauchements de séquences dans les régions hypervariables de 2019-nCoV et certains échantillons de VIH, mais les complots continuent à venir, y compris les théories selon lesquelles le l’utilisation des thérapies anti-VIH pour 2019-nCoV signifie que 2019-nCoV est fabriqué à partir du VIH, et l’idée que l’armée chinoise a fabriqué 2019-nCoV il y a deux ans et pour une raison quelconque a publié la séquence de son arme biologique top secrète sur Internet.

Inutile de dire que ces théories ne sont toujours pas vraies et que le nCoV 2019 n’est toujours pas une arme biologique, mais nous aurons bientôt une couverture plus détaillée de ces théories du complot.

De plus, gardez à l’esprit que 2019-nCoV n’est pas un complot pour vendre de l’eau de Javel , ni rien à voir avec la bière Corona .

Le Hubei est toujours en confinement, avec peu de clarté sur sa gravité ou sur le moment où il s’arrêtera

Au Hubei même, la situation est toujours dans un état de confinement total, avec une aggravation des conditions, peu de détails sur leur gravité et des révélations récentes mettant en doute la fiabilité des informations.

Le nombre de cas confirmés a continué d’augmenter, avec le dernier nombre de cas à plus de 11 000 cas confirmés au Hubei. La croissance a ralenti, en pourcentage, mais comme nous l’avons vu précédemment, il n’est toujours pas possible de confirmer si la réduction est due à une réduction du taux de croissance réel de l’épidémie, ou à un ralentissement de la croissance de la constatation, ou tous les deux.

Le taux de croissance sans entrave selon les derniers modèles est d’environ 10% par jour, et le nombre de cas confirmés au Hubei continue d’augmenter d’environ 25% par jour. Les estimations étant encore faibles, les estimations de la fourchette supérieure du nombre réel de cas au Hubei atteignent désormais des centaines de milliers de cas. L’épidémie a atteint une portée gigantesque.

Les mesures de quarantaine du gouvernement chinois n’ont fait que s’intensifier. La ville continue d’être effectivement fermée à la plupart des mouvements, avec tous les espaces publics et les entreprises autres que les installations médicales et une minorité de supermarchés fermés, ainsi que tous les transports en commun, toutes les routes à destination et en provenance du Hubei, et une interdiction de facto continue de voyage en véhicule.

Soixante millions de résidents du Hubei restent effectivement piégés dans leurs maisons, y compris un grand nombre de touristes et de visiteurs. Avec la pénurie de masques, de gants et de lunettes de protection, des photos déchirantes d’équipements de sécurité improvisés fabriqués à partir de bouteilles d’eau, de fruits et d’autres fournitures circulent sur les réseaux sociaux. Pendant ce temps, ceux qui s’aventurent en public déclarent avoir été harcelés par des drones de police volants, qui avertissent les piétons par haut-parleurs de rentrer chez eux.

Alors que le premier des deux hôpitaux spécifiques à Wuhan a été achevé et que l’hôpital, désormais baptisé «Mountain Fire God Hospital», a mis en ligne mille lits d’hôpital supplémentaires avec seulement deux jours de retard.

Il a été largement rapporté que la capacité du gouvernement chinois à tester les patients malades pour une éventuelle infection au nCoV 2019 est loin de répondre à la demande, ce qui conduit les autorités de la santé publique à recourir à la mise en quarantaine des personnes souffrant de fièvre et de toux sans même vérifier si elles ont le 2019-nCoV . Ces patients sont mis en quarantaine à domicile ou dans de grands bâtiments ouverts comme des usines converties en cas d’urgence.

Cette dernière mesure, qui rappelle les mesures prises dans le monde lors de la pandémie de grippe de 1918, soulève la possibilité inquiétante que les patients atteints de rhume et de grippe puissent être mis en quarantaine avec les patients du nCoV 2019 et en contracter la maladie en grand nombre.

Le gouvernement chinois continue de censurer les nouvelles de sa gravité réelle

Hier, un rapport explosif dans le magazine chinois indépendant Caixing a révélé qu’un grand nombre de décès suspects de 2019-nCoV ont été envoyés directement aux morgues sans avoir été testés pour 2019-nCoV ou ajoutés aux chiffres officiels, identifiés uniquement comme souffrant d’une pneumonie cryptique.

Le long métrage a été censuré par le gouvernement chinois presque immédiatement après sa publication, mais survit sur des sites d’archives.

Caixing cite un hôpital qui, selon les instructions du gouvernement local, n’a consigné comme confirmé que les cas admis à l’hôpital et soumis à des tests de PCR, ce qui, en raison du manque de fournitures de test, représente moins de 10% des cas suspects.

Ceux qui meurent sans diagnostic confirmé ne parviennent jamais sur la liste des cas confirmés, car aucun matériel de test n’est disponible pour les morts. Dans plusieurs hôpitaux, l’attente d’un lit a duré près de quatre jours.

Dans un autre hôpital, Caixing a rapporté qu’un nouvel ajout majeur de lits résultant de la conversion d’un autre établissement en salle de traitement des coronavirus avait été entravé par le manque de vêtements de protection pour les travailleurs médicaux, laissant les nouveaux lits largement vides.

Avec la pénurie de lits et la capacité de test, des milliers de patients atteints du nCoV 2019 souffrent et meurent parfois au Hubei sans traitement médical significatif, leurs cas étant largement non déclarés dans les chiffres officiels. Sans aucune confirmation du nombre de ces cas, il est difficile de savoir si la sous-estimation du nombre officiel de cas et de décès est marginale ou très significative, mais un médecin traitant a déclaré à Caixing que son service avait vu plus de décès que de sorties de patients, l’inverse de ce qui est vu dans les statistiques officielles .

Une pénurie déconcertante de tests conduit à un sous-diagnostic systématique et à une propagation accrue

Caixing a rapporté que sur les dix principaux hôpitaux de Wuhan ayant la capacité de tester le nCoV 2019 avec le test PCR, un grand hôpital n’avait pas la capacité de tester plus de 100 tests PCR par jour, tandis qu’un autre a déclaré n’avoir que 10 tests par jour. Ils citent un médecin, qui supervise un service de 600 cas graves mais incapable de tester aucun d’entre eux, disant qu’il ne comprenait pas pourquoi la capacité de test manquait. La Commission sanitaire et médicale de Wuhan a déclaré le 27 janvier qu’elle avait la capacité de 2000 tests par jour et qu’elle se développerait à partir de là.

On ne sait pas vraiment pourquoi, des semaines après que l’épidémie a commencé à exploser, la capacité de test resterait un tel goulot d’étranglement. Les tests PCR ne sont pas techniquement compliqués, et en théorie, un étudiant de premier cycle dans un laboratoire peut concevoir et commander des amorces et effectuer un tel test indépendamment, si nécessaire.

Les hôpitaux des pays développés entretiennent régulièrement des installations de test PCR avec une capacité de milliers de tests par jour. Ces types de machines ne nécessitent qu’une paire d’amorces différente pour passer du test d’un virus à un autre, et une cuillère à soupe d’amorce qui coûte une somme d’argent très modeste à fabriquer et peut être expédiée du jour au lendemain par des fournisseurs comme IDT peut contenir suffisamment matériel pour mille tests. Et la Chine, ces dernières années, est devenue un concurrent mondial dans la biotechnologie des acides nucléiques, avec le fournisseur de séquençage natif BGI allant de pair avec le géant américain du séquençage Illumina sur de nombreuses mesures.

La Chine devrait donc être en mesure de faire autant de tests de PCR que nécessaire. Que la pénurie de capacités de test soit principalement une question de problèmes de suivi des cas, de goulots d’étranglement dans les étapes du processus autres que la réaction de PCR elle-même, ou d’incompétence simple, reste à voir, tout comme le temps qui s’écoule avant cette étrange erreur non forcée. corrigée.

Signes potentiels de confinement dans l’ancienne Chine continentale du Hubei, avec incertitude

Ailleurs en Chine, la situation semble nettement moins dramatique. Chaque province chinoise fait face à des cas, avec plus d’une douzaine de provinces face à des centaines chacune, mais les derniers chiffres de cas montrent seulement une croissance de 15% du nombre de cas dans les 13 principales provinces en dehors du Hubei au cours des deux derniers jours. Cela signifie qu’à moins que la constatation ne baisse réellement (ou que les livres soient en cours de préparation), la quarantaine réduit avec succès le nombre de cas dans les provinces en dehors du Hubei . En fait, le nombre absolu de nouveaux cas confirmés dans les rapports récents a en fait diminué ces derniers jours.

Bien que cette situation soit mauvaise, elle est loin d’être aussi mauvaise qu’à Wuhan, et en particulier, la capacité des lits d’hôpitaux et les tests PCR semblent adéquats jusqu’à présent, selon les rapports officiels. Que ces rapports soient exacts ou présentent des problèmes similaires à ceux du Hubei et, dans l’affirmative, leur gravité reste inconnue.

Les grandes villes chinoises restent sous une forme de quarantaine flexible, la plupart des citoyens des villes profondément touchées comme Guangzhou s’abritant sur place, bien que ce ne soit pas le cas dans le Hubei. Les espaces publics restent fermés dans la majeure partie de la Chine et la fête nationale du nouvel an a été prolongée jusqu’au 9 février au moins.

Les rapports de nos contacts à Pékin et à Shanghai continuent d’indiquer que les disponibilités alimentaires et les prix sont presque normaux , bien que des rapports sporadiques venus d’ailleurs suggèrent des pénuries et des fermetures de supermarchés dans certains quartiers.

Si les conditions suivantes sont réunies, alors l’avenir de l’épidémie dans l’ex-Chine continentale du Hubei semble être parallèle à l’expérience du SRAS à plus grande échelle:

  • Les statistiques officielles sont au moins un peu plus proches de la réalité dans les grandes villes chinoises qu’au Hubei
  • Le système de santé publique reste intact
  • Les cas sont systématiquement identifiés et mis en quarantaine dans les hôpitaux
  • La capacité reste adéquate
  • La mise en quarantaine du Hubei empêche un grand nombre de cas de migrer

Si tout ce qui précède est vrai, nous nous attendons à ce que le nombre de cas tombe lentement à zéro, car la valeur de R est poussée en dessous de un par des mesures de santé publique. Si les mesures de santé publique réduisent R à 0,4, comme dans le cas du SRAS, et si l’intervalle de série est de sept jours, alors le nouveau nombre de cas chuterait d’environ un facteur quarante chaque mois, permettant à l’épidémie d’être efficacement exterminée dans la plupart La Chine dans quelques mois. C’est le meilleur scénario pour la Chine en dehors du Hubei, mais il reste impossible à confirmer pour l’instant.

Un défi potentiel à ce scénario sera l’interruption de la mise en quarantaine au cours de la semaine prochaine alors que les voyageurs à travers la Chine rentreront chez eux après les vacances du nouvel an, et que les lieux de travail à travers la Chine rouvriront. Si les statistiques confirment des indices récents d’une réduction du nombre de cas, la question restera de savoir si la tendance se poursuit alors que les effets de cette migration et de la réouverture des entreprises se font sentir.

La colère chinoise monte sur les réseaux sociaux

Au milieu des souffrances et du chaos dans le Hubei et à travers le pays, avec la véritable profondeur de la situation incertaine, la colère contre les gouvernements locaux et nationaux a atteint son paroxysme.

Une fureur particulière a été exprimée contre la Croix-Rouge du Hubei et ses relations avec le gouvernement local du Hubei, les accusations d’incompétence et de racket circulant largement.

Il y a également eu des rapports limités et non confirmés d’instabilité au sein du gouvernement national. Cela soulève la double possibilité de réformes précipitées permettant d’améliorer la capacité de réaction à l’urgence ou d’aggraver encore l’instabilité politique.

2019-nCoV pourrait bientôt être contenue sur la scène mondiale, alors que l’attention se porte sur l’Allemagne, et le tiers monde

Dans le monde en dehors de la Chine continentale, le nombre total de cas s’élève à 182 selon la dernière mise à jour sur le portail Johns Hopkins, en hausse de seulement 11% par rapport à il y a deux jours. Il semble que le nombre de cas arrivant de Chine a été considérablement réduit par les restrictions de voyage et que la plupart des cas importés n’entraînent pas de propagation significative, du moins jusqu’à présent.

Depuis la déclaration par l’OMS d’une urgence de santé publique de portée internationale, les États-Unis ont emboîté le pas avec leur propre déclaration. D’autres gouvernements ont détourné et filtré des voyageurs de Chine, détourné des avions privés pour ramener leurs citoyens de Wuhan, mis ces citoyens en quarantaine à leur arrivée, rappelé leurs diplomates, interdit les voyageurs chinois et même fermé les frontières. 3M a mis des masques de protection sur l’allocation mondiale, réduisant les fournitures à des fins non urgentes, tandis que les compagnies aériennes du monde entier ont cessé de voler vers la Chine.

Air Canada a suspendu tous ses vols à destination de Pékin et Shanghai jusqu’au 29 février, après que le gouvernement du Canada a recommandé d’éviter les voyages non essentiels en Chine continentale en raison de l’épidémie de coronavirus qui y sévit.

Delta, United et American ont annoncé une suspension de tous les vols à destination et en provenance de Chine, les derniers vols ayant eu lieu au cours des prochains jours.

Le gouvernement américain a annoncé qu’il construisait des installations spéciales de quarantaine pour les voyageurs en provenance de Chine qui présentent des symptômes, dans les complexes de logements des bases militaires. Et, malheureusement, un racisme ouvert important contre le peuple chinois aux États-Unis est apparu en relation avec l’épidémie. Chose que nous retrouvons également en France.

La réponse du nombre de cas à ces efforts semble être significative . Bien que les États-Unis aient connu une transmission entre des membres de la famille et que le cas de transmission en milieu de travail allemand s’est étendu à un groupe de cas comprenant au moins une transmission de troisième génération, les rapports continuent de suggérer que la plupart des cas importés identifiés n’ont pas encore produit de transmission significative.

La situation semble globalement similaire à ce qui s’est produit avec le SRAS. Aux États-Unis, par exemple, sur les cinq cas importés âgés de plus d’une semaine, un seul a transmis, et uniquement au sein de la famille. Il semble que dans le premier monde, les cas importés ne conduisent pas à des épidémies locales autosuffisantes.

La situation dans le tiers monde reste moins claire. Les cas confirmés en Thaïlande, en Malaisie, au Vietnam, aux Émirats arabes unis, en Russie, aux Philippines et au Cambodge sont surveillés de près pour détecter des signes susceptibles d’entraîner des épidémies locales.

Certains pays africains confrontés à des cas suspects ou qui les attendent ont notifié à l’OMS qu’ils souhaiteraient une assistance pour préparer la capacité locale de dépistage, car peu d’hôpitaux dans de nombreux pays du continent disposent d’installations de PCR.

Les pays aux capacités limitées peuvent être confrontés à des épidémies autonomes même si la Chine et les pays développés réussissent à freiner la propagation de la nCoV 2019, et s’ils le font, une situation catastrophique comme celle de la province du Hubei pourrait se développer dans un ou plusieurs d’entre eux en quelques mois seulement.

Principales questions en suspens à surveiller

À mesure que la situation évolue, il y aura plusieurs questions importantes à surveiller, notamment:

  • Si 2019-nCoV devient globalement confiné en dehors de la Chine, ou si un pays ex-Chine a une grande épidémie
  • Si les signes de confinement en Chine en dehors du Hubei tiennent
  • Quelles nouvelles arrivent sur l’exactitude des statistiques épidémiques de la Chine
  • Quand la situation au Hubei cesse d’exploser et à quel point elle a déjà explosé
  • Si les lacunes de capacité dans les tests de PCR et les lits d’hôpitaux au Hubei se résorbent
  • Si la situation politique en Chine subit un bouleversement

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2019-nCoV presque contenu dans certaines régions ?

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